Program Studi Teknologi Rekayasa Pangan (TRP), Program Sarjana Terapan, merupakan Program Studi di Politeknik Pertanian Negeri Kupang yang pengelolaannya berada di bawah Jurusan Tanaman Pangan dan Hortikultura. Program Studi Teknologi Rekayasa Pangan mulai menerima mahasiswa sejak Semester Ganjil 2020/2021 berdasarkan Surat Keputusan Pembukaan Program Studi Nomor 164/M/2020, yang ditandatangani oleh Sekretaris Jenderal atas nama Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Tanggal 31 Januari 2020. Program Studi Teknologi Rekayasa Pangan telah melakukan akreditasi dengan peringkat nilai akreditasi terakhir berada pada peringkat “BAIK” dengan Surat Keputusan Direktur Dewan Eksekutif BAN PT Nomor 5073/SK/BAN-PT/Ak/STr/XII/2023 Tanggal 5 Desember 2023.